Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND3P30281 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND3P30281 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND3P30281 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND3P30281 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND3P30281 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND3P30281 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND3P30281 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms