Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID4AP29374 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms