Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRMP28827 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRMP28827 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
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