Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB5P28074 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB5P28074 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms