Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA3P26006 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms