Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA2P24043 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA2P24043 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms