Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KB1P23443 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KB1P23443 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KB1P23443 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KB1P23443 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KB1P23443 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms