Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AMPD1P23109 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms