Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX1P22670 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX1P22670 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX1P22670 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RFX1P22670 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX1P22670 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX1P22670 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX1P22670 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX1P22670 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms