Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK11BP21127 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK11BP21127 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms