Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT4P19013 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT4P19013 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT4P19013 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT4P19013 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT4P19013 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT4P19013 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT4P19013 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT4P19013 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT4P19013 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT4P19013 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms