Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB2P17787 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms