Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB9P17482 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms