Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOT1P17174 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOT1P17174 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOT1P17174 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOT1P17174 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOT1P17174 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms