Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRAP16234 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms