Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB4P16144 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB4P16144 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms