Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
DSPP15924 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSPP15924 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSPP15924 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DSPP15924 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSPP15924 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSPP15924 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSPP15924 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSPP15924 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSPP15924 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms