Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDPSP14324 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDPSP14324 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDPSP14324 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDPSP14324 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDPSP14324 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDPSP14324 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDPSP14324 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDPSP14324 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDPSP14324 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDPSP14324 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDPSP14324 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDPSP14324 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDPSP14324 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDPSP14324 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDPSP14324 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDPSP14324 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FDPSP14324 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FDPSP14324 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms