Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFTRP13569 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFTRP13569 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFTRP13569 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFTRP13569 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFTRP13569 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFTRP13569 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFTRP13569 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFTRP13569 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CFTRP13569 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CFTRP13569 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CFTRP13569 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFTRP13569 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CFTRP13569 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFTRP13569 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFTRP13569 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFTRP13569 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFTRP13569 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFTRP13569 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFTRP13569 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFTRP13569 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFTRP13569 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFTRP13569 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CFTRP13569 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFTRP13569 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFTRP13569 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFTRP13569 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFTRP13569 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFTRP13569 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CFTRP13569 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CFTRP13569 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFTRP13569 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFTRP13569 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFTRP13569 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CFTRP13569 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CFTRP13569 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CFTRP13569 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CFTRP13569 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFTRP13569 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms