Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GP1BBP13224 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms