Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL6A2P12110 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL6A2P12110 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms