Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL11A1P12107 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms