Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK4P11802 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK4P11802 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK4P11802 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK4P11802 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK4P11802 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK4P11802 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK4P11802 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK4P11802 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK4P11802 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK4P11802 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK4P11802 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK4P11802 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms