Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms