Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSLP07711 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSLP07711 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSLP07711 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSLP07711 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSLP07711 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSLP07711 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms