Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNC2P02585 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms