Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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