Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1O95476 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms