Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG2O94898 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG2O94898 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms