Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TLR5O60602 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR5O60602 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR5O60602 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR5O60602 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms