Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PPLO60437 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPLO60437 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPLO60437 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPLO60437 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPLO60437 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPLO60437 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPLO60437 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPLO60437 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPLO60437 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PPLO60437 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPLO60437 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPLO60437 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPLO60437 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPLO60437 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPLO60437 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPLO60437 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPLO60437 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPLO60437 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPLO60437 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPLO60437 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPLO60437 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPLO60437 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PPLO60437 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPLO60437 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms