Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms