Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMINO43313 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMINO43313 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATMINO43313 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATMINO43313 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMINO43313 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMINO43313 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms