Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIAH2O43255 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms