Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPSS1O43252 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms