Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms