Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2DO15399 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms