Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASKO14936 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASKO14936 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASKO14936 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASKO14936 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASKO14936 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASKO14936 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASKO14936 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASKO14936 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASKO14936 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASKO14936 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASKO14936 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASKO14936 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASKO14936 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASKO14936 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms