Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APAF1O14727 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APAF1O14727 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APAF1O14727 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
APAF1O14727 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
APAF1O14727 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
APAF1O14727 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APAF1O14727 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms