Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS3O14543 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOCS3O14543 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms