Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF103O00237 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF103O00237 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF103O00237 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF103O00237 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF103O00237 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF103O00237 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF103O00237 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF103O00237 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF103O00237 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF103O00237 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF103O00237 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms