Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 782.5 ms