Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PBE3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PBE3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PBE3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E9PBE3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PBE3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PBE3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PBE3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms