Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms