Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms