Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRRM3A6NNA2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRM3A6NNA2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms