Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCCD1A6NED2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms