Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms