Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms