Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCRBV5S1A1TA0A578 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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